Ondřej začal svou kariéru v Opavě, brzy se však stěhoval do Mladé Boleslavi, odkud s nálepkou velkého talentu přestoupil v roce 2006 do Groningenu. V Holandsku odehrál 59 utkání a vstřelil dvě branky, vzápětí se ale zranil a klub mu smlouvu neprodloužil. Do Sparty přišel v roce 2011 jako volný hráč.
